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以3年为周期的全国抗菌药物临床应用专项整治活动，2012年达至新高潮。历经近1年的讨论和20余遍修改后，被称为史上最严厉的《抗菌药物临床应用管理办法》（下简称“《办法》”）于2012年5月8日正式出台。同一时期，覆盖更广、更深的抗菌药物临床应用专项整治活动也拉开了序幕。
就2011年对全国430多家二级以上医院的检查结果来看，绝大多数医疗机构抗菌药物品种数控制在要求范围内，医疗机构门诊、住院患者抗菌药物使用率明显下降，清洁切口手术预防使用抗菌药物的比例下降更为明显，品种选择、用药时机和疗程合理率明显提高，抗菌药物临床应用结构趋于合理，一代头孢菌素使用比例明显上升，三、四代头孢菌素和喹诺酮类抗菌药物使用比例明显下降。
尽管医疗机构抗菌药物品种数、住院患者抗菌药物使用率等抗菌药物临床应用的量化指标，有必要根据工作情况进行动态调整，但考虑到以卫生部令发布的《办法》不宜频繁修订，2012年的专项整治方案成了这方面执行的实际标准。
就新方案中对品种品规数量的限定要求会否影响正常医疗的疑问，卫生部方面回应，所限定的抗菌药物品种数量是基于充分调研和论证，而且具体选用的品种，是由各医院根据综合评估的结果自行确定和调整，因此完全能满足临床诊疗实际。
“应该讲，临床药师在抗菌药物合理使用的评估过程中还会发挥越来越大的作用，但是除了他们以外，在医院里面应该还有其他专业人员会积极参与这个过程。比如这次抗菌药管理办法中提到的感染科的医生，还有临床微生物的专家，这些都是直接提供技术支撑的专业人员，在医院中，他们会发挥越来越重要的作用。”浙江大学医学院附属第一医院肖永红教授如是指出。
抗菌药物临床应用的评估干预、微生物标本检测与细菌耐药监测、抗菌药物处方点评等专业技术类制度的强化，必然涉及医疗机构多部门人员的共同协作，可以预见的是，《办法》的出台实施将进一步推动临床分工向专业化方向发展。
在此基础上，2012年的专项整治方案将“充分利用信息化手段加强抗菌药物临床应用管理”列为重点内容。这一方面表明，医疗机构利用电子处方点评系统加大对医师处方权限和药师处方调剂资格的管理力度，是大势所趋；另一方面，扩大“两网”（抗菌药物临床应用监测网和细菌耐药监测网）的监测单位，本身又是推进公立医院信息化工程建设的一部分。
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