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4月21日凌晨5时，国家卫生和计划生育委员会抗震救灾卫生应急领导小组前方协调组召开全体碰头会。会议要求，实行医疗救援全覆盖，派出医疗队徒步推进到宝兴县；4月21日实现卫生防疫全覆盖；保证药品、器械供应全覆盖。
据悉，5支国家紧急医学救援队目前已到位开展工作，国家级医疗专家组已到雅安，卫生计生委调派的疾控专家于4月21日下午到达。
4月21日，第二批国家医疗专家组从北京、上海和江苏分头赶赴成都，协助开展重症地震伤员医疗救治工作。第二批国家医疗专家组共16人，由重症医学科、骨科、神经外科、普通外科、胸外科、感染科、肾内科、小儿骨科和康复科等相关专业专家组成，包括1名中国工程院院士。
据悉，芦山地震发生后，国务院成立了抗震救灾指挥部，卫生计生委作为医疗救治和卫生防疫组牵头单位，第一时间启动自然灾害卫生应急响应机制，成立以卫生计生委主任李斌为组长的卫生计生委抗震救灾卫生应急领导小组。在四川省成立前方协调组，和四川省卫生厅一起，负责统一协调和调度卫生应急队伍和物资。从北京市选派第一支国家专家医疗队共计33人赶赴灾区，开展医疗救治；派出卫生防疫专家组，对灾区开展公共卫生风险评估，指导卫生防疫和卫生监督工作；发出伤员救治工作指导意见和卫生防疫工作指导意见；坚持“两条线”作战，在做好救灾工作的同时，继续做好人感染H7N9禽流感防控工作。
此后，卫生计生委发出紧急通知，要求做好检伤分类和重症伤员分流工作，确定定点医院，按照集中伤员、集中专家、集中资源、集中救治的“四集中”原则，对地震伤员进行集中救治。要合理调整防疫队伍布局，有针对性地补充防疫力量，协助灾区尽快恢复建立传染病疫情和突发公共卫生事件网络直报系统，实行灾害相关传染病疫情和突发公共卫生事件日报告和零报告制度。对灾民安置点，驻地医疗队要专人包干负责，每日巡查；切实落实对霍乱、甲肝、痢疾、麻疹、乙脑、血吸虫病等重点传染病防控措施，尽快恢复常规免疫接种，适时开展应急接种。合理确定水质监测计划和监测指标，防范介水传染病及群体性饮用水安全事件发生。
4月20日晚，李斌赶赴雅安市芦山县人民医院，并看望国家紧急医学救援队，慰问医护人员，主持召开专题会议，研究部署地震灾区医疗卫生救援工作。
截至4月21日，雅安、成都、眉山等18个市州，共186人遇难；灾区共救治伤员8761人次，住院1397人，其中重症及危重症265人。已到达灾区的医务救护队共183支、医护人员1427名，卫生防疫队12支共110余人。四川省卫生计生部门预备医疗队138支共1472人，储备血液4000余单位、血浆65万毫升。
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